Salariée et freelance

[a2doc]

Bonjour,
Je suis salariée en CAE dans une assoc, dans laquelle je suis très mal payée. Pour arrondir les fins de mois, j'ai une autrea assoc qui me fait faire des petits travaux de mise en page, créa d'affiches... Elle veut que je lui fasse une facture pour qu'elle puisse me rémunérer honnetement et en me déclarant.
Juste avant de trouver cette emploi (Le CAE) j'ai crée une société pour laquelle j'ai juste un N° APE et N° SIRET. Je n'ai jamais rien déclaré encore dessus. SI je le passe sur cette société est ce que je vais commencer à payer des charges?
Dois je faire autrement?
Je me rend compte que ma question peut parretre tres bête, mais je n'y connais rien.
J'attends avec impatience vos idées et conseilles.
Merci